
Quand on démarre une activité en tant que micro-entrepreneur, chaque heure compte. Entre la gestion des clients, la communication et la comptabilité, le temps est une ressource précieuse. Or, la facturation fait partie des tâches incontournables, à la fois pour des raisons légales, fiscales et commerciales.
C’est là qu’intervient le meilleur logiciel de facturation pour micro-entrepreneur : un outil simple, conforme, et pensé pour les indépendants. Que vous vendiez des prestations de service ou des produits, vous avez tout intérêt à automatiser la création de devis, l’émission de factures, le suivi des paiements et la gestion des justificatifs.
Mais encore faut-il choisir une solution adaptée à votre statut, vos besoins, votre budget. Dans ce guide, nous vous aidons à comparer et choisir l’outil de facturation idéal pour votre micro-entreprise.
Pourquoi un logiciel est indispensable pour un micro-entrepreneur ?
Respect des obligations légales
Depuis l’entrée en vigueur de la loi anti-fraude à la TVA (2018), les logiciels de facturation doivent garantir l’inaltérabilité, la sécurisation, la conservation et l’archivage des données. Si vous êtes redevable de la TVA ou souhaitez être irréprochable, utiliser un logiciel conforme est essentiel.
Même si vous bénéficiez d’une franchise de TVA, votre logiciel doit vous permettre de mentionner clairement “TVA non applicable, art. 293 B du CGI” sur vos factures.
Gain de temps et de rigueur
Les logiciels de facturation automatisent les tâches répétitives :
- Numérotation automatique des factures
- Génération de devis convertibles en factures
- Relances clients
- Gestion des paiements partiels ou en retard
- Exports pour la comptabilité
Un véritable gain de productivité, surtout quand on est seul à tout gérer.
Compatibilité avec l’URSSAF
Certaines solutions proposent des exports compatibles URSSAF ou des rapports synthétiques facilitant vos déclarations mensuelles ou trimestrielles. Cela limite les erreurs et sécurise votre comptabilité.
Les critères essentiels à comparer
Avant de choisir le meilleur logiciel de facturation pour micro-entrepreneur, posez-vous les bonnes questions :
1. Simplicité et ergonomie
Une interface claire, en français, intuitive même pour les non-comptables est indispensable. Vous ne devez pas perdre du temps à chercher chaque fonction.
2. Fonctionnalités clés
- Création de devis et factures personnalisables
- Gestion des clients et produits
- Paiement en ligne
- Relances automatiques
- Archivage légal
- Facturation récurrente (si abonnement)
3. Conformité légale
Vérifiez que le logiciel est certifié loi anti-fraude si nécessaire, et permet de bien indiquer votre statut de micro-entrepreneur.
4. Support client et assistance
En cas de problème, le support réactif et francophone est un vrai plus. Préférez les solutions avec chat, email ou téléphone.
5. Tarification et essai gratuit
Certaines solutions proposent une version gratuite, mais attention aux limitations. Un bon compromis : l’essai gratuit 14 ou 30 jours.
Top 3 des meilleurs logiciels de facturation pour micro-entrepreneurs
Freebe – Le chouchou des freelances
Conçu pour les indépendants, Freebe automatise votre facturation et vos déclarations URSSAF.
- Avantages :
- Interface ultra fluide
- Déclaration URSSAF intégrée
- Suivi CA et plafond micro-entreprise
- Synchronisation bancaire
- Limites :
- Uniquement pour prestataires de service
- Pas adapté à la vente de produits
- Prix : à partir de 11 €/mois
- Essai gratuit 30 jours
Henrri – Le plus complet (et gratuit)
Développé par une société d’expertise comptable, Henrri est gratuit à vie, sans pub.
- Avantages :
- 100 % gratuit et complet
- Conforme loi anti-fraude
- Devis, factures, relances, bibliothèque d’articles
- Limites :
- Moins d’automatisations qu’un outil premium
- Interface un peu dense pour les débutants
- Prix : gratuit
- Découvrir Henrri
Axonaut – Le plus pro
CRM + devis + facturation + gestion : tout-en-un pour auto-entrepreneurs ambitieux.
- Avantages :
- Complet : facturation, relances, CRM
- Paiement CB, prélèvements
- Multi-utilisateur possible
- Limites :
- Tarification un peu élevée pour une petite activité
- Moins centré sur les besoins micro-entrepreneurs purs
- Prix : à partir de 39 €/mois
- Essai gratuit 15 jours
Tableau comparatif synthétique
| Logiciel | Tarif | Fonctionnalités clés | Compatibilité URSSAF | Essai gratuit | Lien |
|---|---|---|---|---|---|
| Henrri | Gratuit | Devis, factures, relances | ⚠️ Partiel | Non, gratuit | Utiliser Henrri |
| Freebe | 11€/mois | Factures, URSSAF, CA, banque | ✅ Oui | 30 jours | Essayer Freebe |
| Axonaut | 39€/mois | CRM, relances, paiements | ✅ Oui | 15 jours | Découvrir Axonaut |
Quel logiciel choisir selon son activité ?
Début d’activité / activité secondaire
Henrri est idéal : gratuit, conforme, accessible pour tester sans risque.
Début d’activité / activité secondaire
Freebe est fait pour vous : déclaration URSSAF, calcul CA automatique, ergonomie top.
Début d’activité / activité secondaire
Axonaut (ou alternatives comme Sellsy ou QuickBooks) est plus adapté pour gérer stocks, paiements et relances poussées.
Questions fréquentes
Quel est le logiciel le plus simple pour un débutant ?
Freebe pour sa clarté, ou Henrri pour sa gratuité. Les deux sont parfaits pour démarrer sans stress.
Puis-je facturer sans être immatriculé ?
Non. Vous devez être immatriculé en tant que micro-entrepreneur via le guichet unique (voir service-public.fr) pour émettre des factures légalement.
Faut-il déclarer chaque facture à l’URSSAF ?
Non. Vous dĂ©clarez votre chiffre d’affaires global, pas chaque facture individuellement. Un logiciel vous aide Ă le suivre.
Un logiciel gratuit est-il légal ?
Oui, tant qu’il respecte les règles de conformité (non-modification des données, numérotation continue…). Henrri est une bonne option légale.
Puis-je utiliser Excel au lieu d’un logiciel ?
Techniquement oui, mais fortement déconseillé. Excel n’est pas conforme à la loi anti-fraude, et vous risquez des erreurs et sanctions en cas de contrôle.
Conclusion
Choisir le meilleur logiciel de facturation pour micro-entrepreneur n’est pas une dépense, c’est un investissement. Un bon outil vous fera gagner du temps, sécurisera vos obligations légales et vous offrira une vision claire de votre activité.
Pour résumer :
- Freebe : le meilleur pour les freelances
- Henrri : gratuit et fiable pour débuter
- Axonaut : puissant pour les projets ambitieux

