Meilleur logiciel de facturation pour micro-entrepreneur : notre top 3 en 2025

Micro-entrepreneur utilisant un logiciel de facturation en ligne sur ordinateur portable dans un bureau moderne

Quand on dĂ©marre une activitĂ© en tant que micro-entrepreneur, chaque heure compte. Entre la gestion des clients, la communication et la comptabilitĂ©, le temps est une ressource prĂ©cieuse. Or, la facturation fait partie des tâches incontournables, Ă  la fois pour des raisons lĂ©gales, fiscales et commerciales.

C’est lĂ  qu’intervient le meilleur logiciel de facturation pour micro-entrepreneur : un outil simple, conforme, et pensĂ© pour les indĂ©pendants. Que vous vendiez des prestations de service ou des produits, vous avez tout intĂ©rĂŞt Ă  automatiser la crĂ©ation de devis, l’émission de factures, le suivi des paiements et la gestion des justificatifs.

Mais encore faut-il choisir une solution adaptĂ©e Ă  votre statut, vos besoins, votre budget. Dans ce guide, nous vous aidons Ă  comparer et choisir l’outil de facturation idĂ©al pour votre micro-entreprise.

Pourquoi un logiciel est indispensable pour un micro-entrepreneur ?

Respect des obligations légales

Depuis l’entrĂ©e en vigueur de la loi anti-fraude Ă  la TVA (2018), les logiciels de facturation doivent garantir l’inaltĂ©rabilitĂ©, la sĂ©curisation, la conservation et l’archivage des donnĂ©es. Si vous ĂŞtes redevable de la TVA ou souhaitez ĂŞtre irrĂ©prochable, utiliser un logiciel conforme est essentiel.

MĂŞme si vous bĂ©nĂ©ficiez d’une franchise de TVA, votre logiciel doit vous permettre de mentionner clairement “TVA non applicable, art. 293 B du CGI” sur vos factures.

Gain de temps et de rigueur

Les logiciels de facturation automatisent les tâches répétitives :

  • NumĂ©rotation automatique des factures
  • GĂ©nĂ©ration de devis convertibles en factures
  • Relances clients
  • Gestion des paiements partiels ou en retard
  • Exports pour la comptabilitĂ©

Un vĂ©ritable gain de productivitĂ©, surtout quand on est seul Ă  tout gĂ©rer.

Compatibilité avec l’URSSAF

Certaines solutions proposent des exports compatibles URSSAF ou des rapports synthĂ©tiques facilitant vos dĂ©clarations mensuelles ou trimestrielles. Cela limite les erreurs et sĂ©curise votre comptabilitĂ©.

Les critères essentiels à comparer

Avant de choisir le meilleur logiciel de facturation pour micro-entrepreneur, posez-vous les bonnes questions :

1. SimplicitĂ© et ergonomie

Une interface claire, en français, intuitive même pour les non-comptables est indispensable. Vous ne devez pas perdre du temps à chercher chaque fonction.

2. FonctionnalitĂ©s clĂ©s

  • CrĂ©ation de devis et factures personnalisables
  • Gestion des clients et produits
  • Paiement en ligne
  • Relances automatiques
  • Archivage lĂ©gal
  • Facturation rĂ©currente (si abonnement)

3. ConformitĂ© lĂ©gale

VĂ©rifiez que le logiciel est certifiĂ© loi anti-fraude si nĂ©cessaire, et permet de bien indiquer votre statut de micro-entrepreneur.

4. Support client et assistance

En cas de problème, le support rĂ©actif et francophone est un vrai plus. PrĂ©fĂ©rez les solutions avec chat, email ou tĂ©lĂ©phone.

5. Tarification et essai gratuit

Certaines solutions proposent une version gratuite, mais attention aux limitations. Un bon compromis : l’essai gratuit 14 ou 30 jours.

Top 3 des meilleurs logiciels de facturation pour micro-entrepreneurs

Freebe â€“ Le chouchou des freelances

Conçu pour les indépendants, Freebe automatise votre facturation et vos déclarations URSSAF.

  • Avantages :
    • Interface ultra fluide
    • DĂ©claration URSSAF intĂ©grĂ©e
    • Suivi CA et plafond micro-entreprise
    • Synchronisation bancaire
  • Limites :
    • Uniquement pour prestataires de service
    • Pas adaptĂ© Ă  la vente de produits
  • Prix : Ă  partir de 11 €/mois
  • Essai gratuit 30 jours

Henrri â€“ Le plus complet (et gratuit)

Développé par une société d’expertise comptable, Henrri est gratuit à vie, sans pub.

  • Avantages :
    • 100 % gratuit et complet
    • Conforme loi anti-fraude
    • Devis, factures, relances, bibliothèque d’articles
  • Limites :
    • Moins d’automatisations qu’un outil premium
    • Interface un peu dense pour les dĂ©butants
  • Prix : gratuit
  • DĂ©couvrir Henrri

Axonaut â€“ Le plus pro

CRM + devis + facturation + gestion : tout-en-un pour auto-entrepreneurs ambitieux.

  • Avantages :
    • Complet : facturation, relances, CRM
    • Paiement CB, prĂ©lèvements
    • Multi-utilisateur possible
  • Limites :
    • Tarification un peu Ă©levĂ©e pour une petite activitĂ©
    • Moins centrĂ© sur les besoins micro-entrepreneurs purs
  • Prix : Ă  partir de 39 €/mois
  • Essai gratuit 15 jours

Tableau comparatif synthétique

LogicielTarifFonctionnalités clésCompatibilité URSSAFEssai gratuitLien
HenrriGratuitDevis, factures, relances⚠️ PartielNon, gratuitUtiliser Henrri
Freebe11€/moisFactures, URSSAF, CA, banque✅ Oui30 joursEssayer Freebe
Axonaut39€/moisCRM, relances, paiements✅ Oui15 joursDécouvrir Axonaut

Quel logiciel choisir selon son activité ?

Début d’activité / activité secondaire

Henrri est idĂ©al : gratuit, conforme, accessible pour tester sans risque.

Début d’activité / activité secondaire

Freebe est fait pour vous : dĂ©claration URSSAF, calcul CA automatique, ergonomie top.

Début d’activité / activité secondaire

Axonaut (ou alternatives comme Sellsy ou QuickBooks) est plus adaptĂ© pour gĂ©rer stocks, paiements et relances poussĂ©es.

Questions fréquentes

Quel est le logiciel le plus simple pour un débutant ?

Freebe pour sa clartĂ©, ou Henrri pour sa gratuitĂ©. Les deux sont parfaits pour dĂ©marrer sans stress.

Puis-je facturer sans être immatriculé ?

Non. Vous devez ĂŞtre immatriculĂ© en tant que micro-entrepreneur via le guichet unique (voir service-public.fr) pour Ă©mettre des factures lĂ©galement.

Faut-il déclarer chaque facture à l’URSSAF ?

Non. Vous dĂ©clarez votre chiffre d’affaires global, pas chaque facture individuellement. Un logiciel vous aide Ă  le suivre.

Un logiciel gratuit est-il légal ?

Oui, tant qu’il respecte les règles de conformitĂ© (non-modification des donnĂ©es, numĂ©rotation continue…). Henrri est une bonne option lĂ©gale.

Puis-je utiliser Excel au lieu d’un logiciel ?

Techniquement oui, mais fortement dĂ©conseillĂ©. Excel n’est pas conforme Ă  la loi anti-fraude, et vous risquez des erreurs et sanctions en cas de contrĂ´le.

Conclusion

Choisir le meilleur logiciel de facturation pour micro-entrepreneur n’est pas une dĂ©pense, c’est un investissement. Un bon outil vous fera gagner du temps, sĂ©curisera vos obligations lĂ©gales et vous offrira une vision claire de votre activitĂ©.

Pour résumer :

  • Freebe : le meilleur pour les freelances
  • Henrri : gratuit et fiable pour dĂ©buter
  • Axonaut : puissant pour les projets ambitieux